ロシアのミサイル潜水艦がグリーンランド海で秘密任務中に消息を絶った。北方艦隊の最年少司令官、ヴィクトル・ヴォローニンが捜索に赴く。彼の兄は行方不明の巡洋艦の司令官である。一方、極地基地の破壊により、北方海域に怪物が出現する。